PubMed · Nature Genetics· Siyu He·· 3 天前
深度生成模型 CORAL 用于空间组学多尺度多模态整合并发表于 Nature Genetics
Multiscale multimodal integration of spatial omics through a deep generative model with CORAL.
AI 导读
研究者开发 CORAL,一种基于图注意力的概率深度生成模型,整合空间转录组、蛋白组、代谢组与表观基因组数据,生成兼具高空间分辨率和广分子覆盖的统一表征。在合成与多组织实验数据中,CORAL 可识别空间域、预测高分辨率分子谱并推断细胞间相互作用;应用于肝细胞癌患者免疫治疗前后的空间转录组与蛋白组数据时,识别出与治疗耐药相关的免疫细胞亚群和信号通路。
来源:PubMed · Nature Genetics · pubmed.ncbi.nlm.nih.gov