Nature Protocols发表Persephone流程：人全身体代谢模型（WBM）与群体微生物组模型的个性化与分析方法
发表于Nature Protocols的Persephone是用于人全身体代谢模型（WBM）个性化与评估的计算流程，属方法方案，可从原始测序数据构建群体微生物组模型、利用生理与代谢组数据生成个性化WBM并将其合并，还可按用户定义反应优化模型并进行统计与可视化。基于100个宏基因组样本，在单台计算机上运行需数天至一周，未涉及临床结局验证。
#微生物组
PubMed · Nature Protocols PubMed · Lab on a Chip 液滴微流控后光凝胶化方法实现商品化流式分选并回收细菌共培养
研究者报告一种检测后光凝胶化方法：细菌先在水包油液滴中共培养，紫外照射使液滴转化为水凝胶颗粒后用商品化台式细胞分选仪分选，再经酶解释放细菌；两种荧光微球编码颗粒的分选纯度大于99%，检测后凝胶化的细菌生长与空间分布优于预成形水凝胶。
PubMed · Human Reproduction 卵巢储备功能减退女性粪便微生物组与代谢组改变：横断面观察研究显示Hoylesella与AMH/AFC相关、硬脂酸为关键差异代谢物
一项横断面观察研究纳入郑州大学第一附属医院190名冻胚移植女性（卵巢储备功能减退DOR 91例、正常卵巢储备NOR 99例），以16S rRNA测序和非靶向代谢组学分析肠道微生物与代谢谱。
PubMed · Diseases of the Colon & Rectum 直肠癌根治切除患者低位前切除综合征前瞻性队列研究：术前发生率高于预期且与肠道菌群关联有限
加拿大温哥华St Paul's医院的前瞻性队列纳入71例接受根治性切除并保留肠管连续性的直肠腺癌患者，其中42%（30/71）在治疗前即达到低位前切除综合征（LARS评分≥21）标准，随访结束时64%存在LARS；新发LARS与肿瘤位置更低相关（p=0.04）。
PubMed · Nature Reviews Microbiology Nature Reviews Microbiology综述：解析益生元纤维应答个体差异与微生物组、功能及临床结局的关联
《Nature Reviews Microbiology》发表一篇综述，讨论个体对益生元及推定益生元可发酵纤维应答差异的潜在原因，以及这种差异如何影响肠道微生物种间及微生物与纤维结构的相互作用。作者归纳了利用系统生物学、机制建模和机器学习预测并优化个体应答的策略，并分析纤维理化结构对微生物应答相似性的影响，提出克服个体间差异、提升临床疗效的解决思路。
PubMed · International Journal of Food Microbiology 地芽孢杆菌噬菌体来源溶菌素LysGPK联合EDTA降低新鲜生菜上大肠杆菌O157:H7的体外与分子机制研究
研究者对来源于Geobacillus噬菌体的内溶素LysGPK进行了重组表达和表征，其对革兰阴性病原体具广谱裂解活性，最适裂解条件为37°C、pH 9.0，并在70°C下保持稳定。
PubMed · Food Research International 蓝靛果多酚-小麦淀粉复合物（LCBP-WS）经肠道菌群-丁酸-H3K27ac-NXPH4-PDX1通路改善2型糖尿病小鼠餐后高血糖的机制研究
研究显示，高压处理的蓝靛果（Lonicera caerulea）多酚与小麦淀粉复合物（LCBP-WS）形成A+V型抗性淀粉，改善雄性2型糖尿病小鼠餐后高血糖、胰岛素抵抗和糖耐量，并提高肠道丁酸与GLP-1水平。
PubMed · American Journal of Physiology-Gastrointestinal and Liver Physiology 前瞻性队列研究：腹腔镜胆囊切除术后12个月肠道菌群呈选择性改变，乳杆菌属持续减少
一项前瞻性队列研究对20名计划行腹腔镜胆囊切除术的患者从术前基线至术后1、3、6、12个月随访，以16S rRNA基因测序分析粪便菌群，随访12个月完成。结果显示总体菌群多样性与群落结构仅轻度变化，但乳杆菌属在术后早期减少并持续保持较低水平；功能预测提示代谢通路仅有轻度改变，无参与者发生临床明显的胆囊切除术后腹泻。