kinGEMs：结合深度学习预测动力学参数随机调优的计算框架，为93个物种构建酶约束基因组规模代谢模型
PLoS Computational Biology 2026-11-06 在线发表一项计算研究，提出整合 CPI-Pred 深度学习模型与 kinGEMs 流程的框架，从序列和化合物嵌入预测催化常数 kcat，并将不确定性参数纳入酶约束基因组规模模型。
#临床方法学
PubMed · PLoS Computational Biology PubMed · American Journal of Physiology-Cell Physiology 动物研究：Sugen/缺氧大鼠重度肺动脉高压模型的右心房与右心室重塑特征分析
一项动物研究在6周龄雄性Wistar大鼠中以Sugen/缺氧（SuHx）诱导肺动脉高压（PH），经导管测压确认右心压力超负荷，并用共聚焦显微镜、micro-CT、光学标测和蛋白质组质谱分析右心房与右心室重塑。
PubMed · American Journal of Physiology-Heart and Circulatory Physiology 心脏手术围术期NR4A2上调并诱发小鼠自发性心律失常：一项动物机制研究
美国生理学杂志-心脏与循环生理发表的一项研究显示，心脏手术患者左心室组织（以供体组织为对照）围术期核受体NR4A2表达上调。诱导心肌细胞特异性过表达NR4A2的小鼠出现自发性心律失常，伴二联体关键蛋白及miR-133a、miR-499下调，Dlk1-Dio3位点36个miRNA超簇上调；诱导前shRNA敲低该多聚顺反子转录本可部分恢复关键蛋白表达并减少心律失常。
PubMed · Journal of Cell Science 基于ddFP的活细胞成像报告系统用于检测晚内体/溶酶体、内质网、线粒体及质膜间的细胞器膜接触位点
研究者开发了一系列基于二聚化依赖荧光蛋白（ddFP）的报告系统，用于在活细胞中可视化、定量并追踪细胞器间膜接触位点（MCS）。其中ddFP LELYS-ER单质粒系统靶向晚内体/溶酶体与内质网接触，可生成稳定报告细胞系，在VAP蛋白家族下调或溶酶体损伤时检测到接触数量变化，且不干扰内源性接触，活细胞成像显示这些接触具有不同的形态、移动性和寿命；同设计还扩展至ER-质膜和ER-线粒体接触。
PubMed · Development Blender 组织地图投影工具（btc）发表：面向3D显微镜数据的交互式组织制图分析插件
研究人员发布开源工具 blender tissue cartography（btc），是3D编辑器Blender的交互式插件，可将体积显微镜图像中的弯曲组织表面（如上皮片）投影为2D图像以进行可视化与定量分析，配套Python库支持2D投影中的3D测量与自定义流程，时间序列数据可批量对齐处理。
PubMed · American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism 去脂体重水化常数0.732的机制基础研究：Wang 2008机制模型分析876名健康成人的年龄与性别差异
一项发表于American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism的机制研究应用Wang 2008去脂体重水化模型，分析876名健康成人（407男、469女）测得的TBW、TBK、体密度和骨矿物质，探讨0.732水化常数的变异基础。
PubMed · Intensive Care Medicine 急性脑损伤重症患者通气试验核心结局集国际Delphi共识研究发表
研究人员针对急性脑损伤（ABI）重症患者机械通气撤离试验结局异质性问题，按COS-STAD/COS-STAD标准开展4轮国际Delphi研究，来自31个国家的多学科小组参与评分。
PubMed · British Journal Of Nutrition 本地食物数据库联合照片辅助24小时膳食回顾提高哥伦比亚成年人膳食评估准确性：与USDA ASA24比较的横断面研究
一项在20名哥伦比亚成年人中开展的横断面研究显示，使用富含本地食物的定制数据库（DbF）结合照片辅助24小时回顾，较USDA ASA24（FNDDS 2017-2018）以称重记录为参照的准确性更高：能量和宏量营养素相关系数ρ>0·90。
PubMed · The Annals of Thoracic Surgery 叙述性综述：心脏术后急性肾损伤药物预防试验为何失败及终点框架重构
Daniel T Engelman 等在 The Annals of Thoracic Surgery 发表特邀叙述性综述，分析2004至2026年33项心脏术后急性肾损伤药物预防的随机试验。
PubMed · The Laryngoscope 儿童与成人胆脂瘤术后复发比较：回顾性队列研究提示儿童年龄为独立复发危险因素
一项回顾性队列研究纳入126例（128耳）初次胆脂瘤手术患者，中位随访5.8年，分析儿童年龄是否独立预测胆脂瘤复发。儿童5年累积复发风险为53.9%（95% CI 34.2%–67.8%），高于成人的19.1%（95% CI 9.5%–27.7%，log-rank p<0.001），差异主要由早期残留病灶驱动（p=0.004）。
PubMed · Nature Chemistry Nature Chemistry：改造双核铜酶（Bacillus megaterium 酪氨酸酶）实现高对映选择性自由基（伪）卤化
研究者在 Nature Chemistry 发表对天然铜酶的系统改造研究，经工程化的 III 型双核铜酶（尤其 Bacillus megaterium 酪氨酸酶 BmTyr）可催化氧化活性酯脱羧叠氮化及此前非血红素铁酶难以实现的对映汇聚溴化、氯化与异硫氰酸化反应。EPR 与紫外-可见光谱确认了野生型及工程菌酪氨酸酶的偶联双核性质并解释活性增强来源；该研究属生物催化方法学平台构建，未涉及患者结局。
PubMed · Journal of Pharmaceutical Sciences 压片机结构变形对实际压缩速度影响定量的实验验证解析方法研究
研究提出一种解析方法，通过计入压片机结构变形和处方可压缩性来计算补偿后的真实压缩速度，并在仪器化压实模拟机上以加载阶段冲头运动数据完成实验验证。应用于生产规模旋转压片机后定量显示，近峰值力处结构机器变形使实际压缩速度降至理论值约一半。该方法仅依赖常规开发与生产环境可测数据，可用于对齐模拟机曲线、优化放大和排查压缩速度相关生产问题。
PubMed · Journal of Clinical Epidemiology 成人患者偏好系统综述方法学质量的meta研究：110篇综述多数评级极低或低，证据图谱归纳17项影响因素
一项方法学伞式综述与证据图谱研究检索9个数据库至2026年4月10日，纳入110篇直接收集成人患者偏好的系统综述，以AMSTAR 2评估质量。结果显示70.9%被评为极低质量、25.5%低、2.7%中等，仅1篇（0.9%）为高质量；最常报告的偏好影响因素为疗效（67.3%）、不良作用/并发症风险（65.5%）和费用（50.0%），证据集中于治疗管理领域和癌症。
PubMed · Journal of Clinical Epidemiology 研究建立EORTC QLQ-CR29量表的临床重要性阈值以解读结直肠癌患者个体PRO评分
一项纳入来自六个国家的240例结直肠癌患者（平均年龄62.2岁，53%为男性）的研究，通过锚定问题和ROC分析为EORTC QLQ-CR29量表的22个量表建立了临床重要性阈值（TCIs）。
PubMed · Journal of Biomechanics 剪切波弹性成像主动肌肉僵硬度指数：斜坡与阶梯收缩两种估测方法不可互换的方法学研究
一项方法学研究比较剪切波弹性成像主动肌肉僵硬度指数的连续斜坡与离散阶梯两种估测方案。30名健康女性以两种方式完成至最大自主收缩50%的等长伸膝，测定股外侧肌剪切模量，结果显示两方案估计值存在显著差异（p<0.001），相关性强（r≈0.88）但一致性较低（CCC≈0.81），Bland-Altman分析示-0.20 kPa/Nm（约20%）系统偏移。
PubMed · Journal of Endodontics 生成式AI在牙髓病学应用的范围综述：50项研究显示表现随任务类型差异明显
一项发表于 Journal of Endodontics 的范围综述检索PubMed、Scopus和Web of Science 2023年1月1日至2025年11月19日的英文研究，纳入50项评估基于大语言模型（LLM）的生成式AI在牙髓病学中应用的研究，其中教育培训20项、诊断与临床支持21项、患者沟通9项，GPT系列模型最常被评估。
PubMed · Nature Protocols 无需轨迹追踪的均方位移分析方案：基于荧光波动对活细胞内亚细胞结构动力学定量（Nature Protocols）
Nature Protocols 发表一种无需单粒子轨迹追踪的图像衍生均方位移分析方案，通过计算荧光强度波动的时空自相关函数，在活细胞中定量蛋白质、细胞器和纳米颗粒的平均时空动力学。方案涵盖图像采集参数优化、时空相关函数计算与高斯拟合，可同时提取扩散系数、异常指数、受限尺度及运动物体的平均尺寸，区分布朗运动、超扩散与受限运动。完整流程约需4–6小时操作时间，要求具备荧光显微镜与数据处理基础经验。
PubMed · Archives of Physical Medicine and Rehabilitation 实时超声辅助喉肌电图采用单一切面轨迹视角：单中心前瞻性单臂可行性研究（N=16）
一项单中心前瞻性单臂可行性研究纳入16名疑诊喉神经肌肉功能障碍成人患者，评估无需电磁追踪、使用单一平面内轨迹视角实时超声引导的喉肌电图（LEMG）。共取样44块肌肉（31块甲杓肌、13块环甲肌），肌电图确认取样成功率100%，环甲肌实时针体完全可视化率100%，甲杓肌仅12.9%，甲状软骨钙化（87.5%）是主要限制因素；不良事件仅为一过性咳嗽（6.8%），无出血、血肿或感染。
PubMed · Pharmaceutical Research 药事计量学方法学研究：AI辅助建模使药代建模者可窥见NONMEM估算引擎内部（Pharmaceutical Research）
一篇发表于Pharmaceutical Research的方法学文章展示，AI辅助可让药事计量建模者以自然语言生成Fortran代码，对NONMEM引擎进行插桩，按需提取平时不可见的内部量。
PubMed · Applied Microbiology and Biotechnology 综述：下一代精准发酵——工程化细胞工厂、生物过程强化与智能生物加工的整合
Applied Microbiology and Biotechnology 发表的综述将精准发酵定义为工程化微生物细胞工厂与代谢工程及过程控制的整合，应用涵盖药物、食品配料、工业酶和生物聚合物。
PubMed · Pharmaceutical Research 基于建模与模拟预测弱碱性药物口服吸收：胃酸抑制药与储存致游离型药物增加的影响
研究者建立了一个模拟模型，结合体外溶解度、渗透性与沉淀实验数据，预测胃pH及片剂储存中游离型药物增加对弱碱性药物口服吸收的影响。模型以健康志愿者胶囊临床数据验证，预测误差在±19%以内，并成功再现了合用胃酸抑制药（ARAs）受试者血浆浓度下降，观测与预测的血浆浓度比值分别为0.14和0.25。该模型可辅助制剂设计与临床开发，尚属模拟方法学研究。
PubMed · Journal of Lipid Research 2-羟基油酸在实验性结肠炎模型中维持脂质稳态与上皮屏障功能（临床前研究）
临床前研究显示，合成油酸衍生物2-羟基油酸（2-OHOA）在IFN-γ/TNF-α刺激的Caco-2单层和DSS诱导小鼠结肠炎模型中可减轻屏障功能障碍、炎症指标和组织损伤，同浓度/剂量油酸（OA）作用微弱。
PubMed · Talanta Talanta发表单体旋转柱脱盐方法研究：快速、不依赖尺寸的核酸高通量样品前处理
一项发表于Talanta的方法学研究开发了基于多模式阴离子交换单体旋转柱的核酸脱盐平台，利用核酸在弱酸性pH下结合、中性pH低电导缓冲液洗脱的原理，快速去除寡核苷酸、质粒DNA和mRNA样品中的残余盐分。该单一装置和通用流程适用于不同尺寸核酸，相比超滤脱盐灵敏度更高、处理速度更快，可作为毛细管凝胶电泳分析前的样品预处理步骤。该研究为体外分析样品前处理方法，尚无临床应用数据。
PubMed · Food and Chemical Toxicology 香原料体外遗传毒性检测策略综述：应对假阳性并推进非动物方法（ToxTracker、3D RSMN、CEGA/HET-MN、OASIS TIMES）
一篇发表于 Food and Chemical Toxicology 的综述提出香原料的分 tier、机制导向全体外遗传毒性检测策略，整合 ToxTracker GFP 报告干细胞平台、3D 重建皮肤微核（RSMN）试验、鸡胚系统 CEGA 与 HET-MN，以及 OASIS TIMES 计算代谢预测，并给出决策流程图。
PubMed · Free Radical Biology and Medicine 靶向胆固醇合成通路诱导氧化应激可增强硼替佐米在多发性骨髓瘤中的疗效（临床前研究）
一项发表于Free Radical Biology and Medicine的研究（PMID 42767467）报告，多发性骨髓瘤（MM）细胞通过SREBF2激活的胆固醇生物合成积累7-脱氢胆固醇（7-DHC），减轻硼替佐米（BTZ）诱导的ROS细胞毒性，高胆固醇合成活性见于BTZ不反应浆细胞并与不良预后相关。
PubMed · The Journal of Pathology 《病理学杂志》发表单细胞RNA测序研究：移行区富集的WIF1+基底细胞亚群与良性前列腺增生相关
一项对前列腺癌切除标本良性区域进行的单细胞RNA测序研究（发表于The Journal of Pathology）发现，表达WIF1、VCAN、NRG1等基因的基底细胞亚群显著富集于前列腺移行区，并经既往公开数据集证实其在良性前列腺增生（BPH）中较正常前列腺显著富集。